コロナワクチン3回目の副反応はいつまで？発熱・倦怠感と2026年の安全性を徹底解説

コロナワクチンの3回目接種後、「翌日から熱が出た」「倦怠感や頭痛がつらい」「3日たっても体調が戻らない」と不安を感じた人は少なくありません。厚生労働省が公表した接種後の健康状況調査によると、3回目接種では発熱が接種翌日に最も多くみられ、接種3日後にはほぼ消失する傾向が確認されています。ファイザーとモデルナでは発熱の頻度にも違いがありました。

2026年11月現在、コロナワクチンの安全性評価は継続されており、心筋炎・心膜炎への注意喚起や、接種後に長引く症状に関する実態調査も公表されています。過去の3回目接種のデータと2026年の最新情報を分けて整理し、通常の副反応が続く期間、医療機関に相談すべき症状、長期的な健康状況について詳しく解説します。

📌 【この記事の重要ポイントまとめ】

- 発熱の目安： 3回目接種後の発熱は翌日にピークを迎え、3日後にはほぼ消失する傾向がある。
- ワクチンの違い： モデルナはファイザーより発熱の頻度が高い傾向が確認されたが、調査対象の違いにも注意が必要。
- 注意すべき症状： 胸痛、息切れ、動悸などは心筋炎・心膜炎の可能性があるため、速やかな受診が必要。
- 2026年の状況： 厚生労働省は長引く症状の実態調査を継続しており、接種後の症状とワクチンとの因果関係は個別に評価する必要がある。

【結論】コロナワクチン3回目の副反応はいつまで？発熱は3日後が回復の目安

コロナワクチン3回目の副反応は、一般的に接種当日から翌日にかけて現れ、数日以内に軽快するケースが多くなっています。

厚生労働省の接種後健康状況調査では、ファイザーとモデルナのいずれについても、発熱は接種翌日の発現頻度が最も高く、3日後にはほぼ消失していました。

ただし、これは調査対象者全体の傾向です。個人差があるため、必ず3日で症状がなくなるという意味ではありません。

接種当日から3日後までの経過

3回目接種後の一般的な経過を整理すると、次のようになります。

- 接種当日： 注射した腕の痛みや違和感が現れることがある。発熱や倦怠感が始まる人もいる。
- 接種翌日： 発熱、頭痛、全身倦怠感、筋肉痛などが強くなりやすい時期。
- 接種2日後： 発熱や頭痛が徐々に軽くなり、体調が回復に向かうケースが多い。
- 接種3日後： 発熱はほぼ消失する傾向。倦怠感や接種部位の痛みが残る場合もある。
- 接種4日目以降： 多くの一般的な副反応は落ち着いていく。ただし、改善しない場合は医療機関への相談が必要。

この経過を理解しておくと、接種翌日の発熱だけで過度に心配する必要がないことが分かります。

一方、発熱が2日間以上続く場合や、症状が重い場合には医療機関への相談が推奨されています。

発熱は何度までなら様子を見てよい？

ワクチン接種後には、37.5℃以上の発熱が起こることがあります。

発熱の数字だけで重症度を判断するのではなく、次の点を確認することが大切です。

- 水分を十分に取れているか
- 意識や受け答えに異常がないか
- 呼吸が苦しくないか
- 時間の経過とともに症状が改善しているか
- 強い頭痛や胸痛など、別の症状が出ていないか

軽い発熱で全身状態が安定している場合は、水分補給と休息を基本に経過を観察します。

ただし、高熱が続く、急激に状態が悪化する、呼吸困難などがある場合は、3日間という目安にこだわらず受診してください。

【症状別】3回目接種後の倦怠感・頭痛・発熱はなぜ起こる？

3回目接種後に多くみられる副反応は、接種部位の痛み、疲労・倦怠感、頭痛、発熱、筋肉痛、関節痛、悪寒などです。

これらは、ワクチン接種後に免疫反応が起こる過程で現れる症状です。

1. 倦怠感・全身のだるさ

3回目接種後に多く報告された症状の一つが全身倦怠感です。

具体的には、次のような状態が考えられます。

- 身体が重く、起き上がるのがつらい
- 十分に睡眠を取っても疲れが残る
- 仕事や家事に集中できない
- 軽い運動でも疲れやすい
- 発熱とともに身体全体がだるくなる

倦怠感は発熱が落ち着いた後も残ることがあります。

無理に普段どおりの生活へ戻そうとせず、睡眠と休息を優先してください。症状が長引く場合や日常生活に支障が出る場合は医師に相談しましょう。

2. 頭痛

頭痛も3回目接種後にみられる代表的な全身症状です。

頭が重い、こめかみが痛む、頭全体が締め付けられるように感じるなど、症状の出方には個人差があります。

発熱や倦怠感と同時に起こることもあります。

水分を補給し、静かな環境で休むことが基本です。必要に応じて解熱鎮痛薬を使用することもできますが、持病や服用中の薬がある場合は医師や薬剤師に確認してください。

突然の激しい頭痛、意識障害、手足の麻痺などがある場合は、通常の副反応と考えず、緊急に医療機関を受診してください。

3. 接種部位の痛み・腫れ

注射した腕の痛みは、比較的よくみられる局所反応です。

腕を上げると痛む、接種部位が熱っぽい、赤みや腫れが出るといった症状があります。

また、3回目接種では、わきの下の痛みやリンパ節の腫れが2回目より多くみられる傾向も報告されました。

多くの場合は時間の経過とともに軽快しますが、腫れが著しい場合や痛みが強くなる場合は医療機関に相談してください。

4. 寒気・筋肉痛・関節痛

悪寒や筋肉痛、関節痛も代表的な全身反応です。

寒気が強くなったり、風邪をひいたときのように身体の節々が痛んだりすることがあります。

発熱と同時に現れることも多いため、体温だけでなく全身の状態を確認することが重要です。

なお、接種後の発熱に咳、喉の痛み、鼻水、味覚・嗅覚の異常などが伴う場合は、新型コロナウイルス感染症など別の原因も考えられます。

【徹底比較】ファイザーとモデルナの3回目副反応はどちらが強い？

3回目接種では、ファイザーを続けて接種する同種接種と、ファイザーからモデルナ、またはモデルナからファイザーへ変更する交互接種が行われました。

厚生労働省の接種後健康状況調査では、これらの組み合わせごとに発熱や倦怠感などの経過が調べられています。

ファイザーとモデルナの調査結果

2022年に公表された中間報告では、初回接種がファイザーだった人について、3回目にファイザーを接種した場合とモデルナを接種した場合が比較されています。

その結果、両方のワクチンで接種部位の痛みや倦怠感が多くみられました。

一方、発熱についてはモデルナのほうがファイザーより高い傾向がありました。

いずれの組み合わせでも、発熱は接種翌日に最も多く、3日後にはほぼ消失する傾向が確認されています。

ただし、初回接種がモデルナだったグループとファイザーだったグループでは、調査対象者の人数、年齢、性別の構成、接種間隔などが異なります。そのため、4つの組み合わせを単純に順位付けすることはできません。

交互接種は同種接種より危険だったのか

交互接種については、異なる種類のワクチンを組み合わせることで副反応が強くなるのではないかという疑問もありました。

しかし、厚生労働省の調査では、交互接種でも同種接種でも、接種部位の痛みや倦怠感などが確認されています。

また、ファイザーからモデルナへ変更した場合には、発熱の頻度が高い傾向が示されました。

ここで重要なのは、発熱頻度の違いと、重篤な健康被害の発生リスクは別の問題だという点です。

発熱が多いという理由だけで、交互接種が危険だったと判断することはできません。

2026年のワクチンと3回目接種の違い

2026年現在、過去の3回目接種で使用された従来型ワクチンと、現在の定期接種で使用されるワクチンは同一ではありません。

現在は流行株に対応する抗原組成への更新が行われており、使用できる製剤も複数あります。

2026年度の定期接種では、ファイザー、モデルナ、第一三共、Meiji Seikaファルマ、武田薬品のワクチンが使用可能です。

したがって、2021～2022年の3回目接種の調査結果を、そのまま2026年の接種後の副反応発現率として扱うことはできません。

【要注意】接種後の心筋炎・心膜炎はどんな症状？受診すべきサイン

3回目接種後の副反応で特に注意したいのが、心筋炎と心膜炎です。

いずれも頻度としては非常にまれですが、ファイザーやモデルナなどのmRNAワクチン接種後に疑い事例が報告されています。

心筋炎・心膜炎とは？

心筋炎は心臓の筋肉に炎症が起きる状態です。

一方、心膜炎は心臓を包む膜に炎症が起きる状態を指します。

厚生労働省によると、これらの疑い事例は特に思春期や若年成人の男性で多く報告されてきました。

また、過去の接種状況では、1回目より2回目接種後に多く、3回目接種後は2回目よりも報告頻度が低い傾向が確認されています。

見逃してはいけない症状

心筋炎・心膜炎が疑われる代表的な症状は次のとおりです。

- 胸の痛み
- 動悸
- 息切れ
- 呼吸が浅く速くなる
- むくみ
- 胸部の圧迫感

特に、接種後4日程度の間に胸痛や息切れが現れた場合は、速やかに医療機関を受診してください。

胸痛が強い、呼吸が苦しい、意識が遠のくなどの症状がある場合は、救急対応が必要です。

PMDAの添付文書にも記載されている

医薬品医療機器総合機構（PMDA）が公開する2026年版のコミナティ添付文書では、心筋炎・心膜炎が重大な副反応として記載されています。

また、心筋炎・心膜炎が疑われる症状として、胸痛、動悸、むくみ、呼吸困難、頻呼吸などが挙げられています。

これは過去の接種時だけの注意事項ではありません。

現在使用されているワクチンについても、添付文書に記載された安全上の注意を確認することが大切です。

なお、心筋炎・心膜炎が疑われる報告があったことと、その症状がワクチンによって引き起こされたと医学的に確定することは同じではありません。

【2026年最新】接種後に長引く症状の実態と厚生労働省の安全性評価

3回目接種後の一般的な副反応は数日以内に軽快することが多い一方、接種後に長期間続く症状を訴える人についても調査が続いています。

2026年の重要な動きとして、厚生労働省が7月24日に公表した「新型コロナワクチン接種後の遷延する症状に係る実態調査」があります。

2026年7月公表の実態調査で分かったこと

この調査は、ワクチン接種後に症状を訴えて専門的な医療機関を受診した人を対象としています。

全国約360の専門的医療機関のうち、調査に協力した146施設を対象に情報を収集しました。

医師からの医学的調査票では、10施設から56症例の回答が得られています。

主な結果は以下のとおりです。

1. 報告された症状

日常生活に支障を来している症状として、次のようなものが報告されました。

- 疼痛：14例
- 倦怠感：11例
- 発熱：9例
- 筋肉痛：6例
- 胸痛：5例
- 息切れ：4例
- 頭痛：4例

症状は多様であり、特定の症状だけに集中していたわけではありません。

2. 接種から症状が出現するまでの期間

医師宛調査では、約87％の症例で接種から症状の発現までが1週間以内でした。

3. 回復・軽快した症例

転帰が確認できた42症例のうち、

- 31例（74％）：回復または軽快
- 10例（24％）：未回復
- 1例：その他

という結果でした。

4. 31日以上症状が続いた症例

症状が31日以上持続した18例のうち、16例（89％）で何らかの診断、または疑い診断に至っています。

そのうち12例（67％）は回復または軽快していました。

また、症状の持続期間のデータが得られた32例のうち、12例では366日以上という長い期間が記録されていました。

ただし、症状が継続している場合の持続期間は最終受診日までで集計されており、すべての症例でその期間中ずっと症状が続いていたと断定できるわけではありません。

この調査をどう受け止めるべきか

ここで特に重要なのが、調査対象の性質です。

この調査は、一般の接種者全体を無作為に調べたものではありません。接種後の症状を訴えて専門的な医療機関を受診した人を対象とする調査です。

したがって、12例という数字を、接種者全体における長期症状の発生率として解釈することはできません。

さらに、厚生労働省の資料では、症状とワクチン接種との因果関係を検証できないこと、回答施設や症例数が限られること、選択バイアスや未回答バイアスを考慮する必要があることが説明されています。

それでも、長期間症状に悩む人が実際に専門医療機関を受診しているという事実は、医療提供体制や継続的な実態把握を考えるうえで重要です。

2026年10月23日の副反応疑い報告

厚生労働省は2026年10月23日にも、予防接種・ワクチン分科会の副反応検討部会を開催しました。

この会議では、2025年10月1日から2026年6月30日までの新型コロナワクチンの副反応疑い報告などが取り上げられています。

ここで注意したいのは、副反応疑い報告は、接種後に発生した症状について報告されたものであり、すべてがワクチンとの因果関係を証明するものではないという点です。

製造販売業者と医療機関からの報告には重複が含まれる可能性があり、追加調査によって報告が取り下げられることもあります。

つまり、報告件数だけを見て安全性を判断することは適切ではありません。

発生頻度、接種回数、年齢・性別、症状の内容、医学的な因果関係の評価などを総合的に確認する必要があります。

2026年度の定期接種はどうなっている？

2026年10月からは、新型コロナワクチンの定期接種が自治体で実施されています。

対象は次の人です。

- 65歳以上の人
- 60～64歳で、心臓・腎臓・呼吸器の機能またはHIVによる免疫機能に一定の障害がある人

接種期間は原則として2026年10月1日から2027年3月31日までです。自治体によって実施期間が異なる場合があります。

また、2026年度の定期接種では、複数の製造販売業者のワクチンが使用可能になっています。

過去の3回目接種の経験だけで現在のワクチンの安全性を判断せず、接種する製剤の最新の添付文書や説明資料を確認することが大切です。

【実践編】3回目接種後に体調が悪いときの対処法と受診の判断基準

副反応が出た場合には、症状の程度と経過に応じて対応を変える必要があります。

自宅でできる基本的な対処

一般的な発熱や倦怠感に対しては、次の対応が基本です。

水分を十分に取る

発熱時は脱水になりやすいため、こまめに水分を補給します。

無理をせず休む

接種当日と翌日は予定を詰め込まず、身体を休める時間を確保してください。

必要に応じて解熱鎮痛薬を使う

発熱や頭痛、筋肉痛がつらい場合には、解熱鎮痛薬を使用できます。持病や服用中の薬がある人、妊娠中の人などは、事前に医師や薬剤師へ相談してください。

接種部位を清潔に保つ

腕に痛みがあっても、強く揉んだり刺激したりすることは避けましょう。

また、接種当日は激しい運動や過度の飲酒を控えることが推奨されています。

医療機関に相談すべきタイミング

次のような場合には、早めに医療機関へ相談してください。

- 発熱が2日間以上続いている
- 症状が時間とともに悪化している
- 強い倦怠感が続いて日常生活に支障がある
- 激しい頭痛や繰り返す嘔吐がある
- 咳、喉の痛み、鼻水など感染症を疑う症状がある
- 接種部位の腫れや痛みが強くなっている

胸痛、息切れ、強い動悸、呼吸困難、意識障害などがある場合は、通常の相談を待たず緊急に医療機関を受診してください。

接種後の健康被害救済制度について

予防接種によって健康被害が発生した場合に備え、日本には予防接種健康被害救済制度があります。

接種後に長引く症状があり、医療機関で診断や治療を受けている場合には、自治体の相談窓口で制度について確認できます。

申請については、原則として接種時に住民票を登録していた市町村が相談先になります。

制度の対象になるかどうかは個別の審査によって判断されます。接種後に症状が出たという時間的な関係だけで、認定が決まるわけではありません。

【よくある質問】コロナワクチン3回目の副反応に関するFAQ

Q1：コロナワクチン3回目の発熱は何日で治りますか？

A1：厚生労働省の健康状況調査では、発熱は接種翌日に最も多く、接種3日後にはほぼ消失する傾向が確認されています。ただし個人差があり、3日を超えて発熱が続く場合は医療機関に相談してください。

Q2：3回目接種後の倦怠感や頭痛はいつまで続きますか？

A2：多くの場合、数日以内に軽快します。発熱がなくなった後も倦怠感や頭痛が残ることはあります。改善しない場合や日常生活に支障がある場合は受診を検討してください。

Q3：ファイザーとモデルナではどちらの副反応が強いですか？

A3：過去の3回目接種後の調査では、初回接種がファイザーだった人の場合、モデルナのほうが発熱頻度が高い傾向でした。ただし、接種部位の痛みや倦怠感は両方で多くみられています。調査対象者の違いもあるため、単純な優劣は判断できません。

Q4：3回目接種から3日後も熱がある場合、コロナに感染した可能性はありますか？

A4：可能性はあります。ワクチンによる発熱は接種後1～2日以内に起こることが多い一方、咳、喉の痛み、鼻水などがある場合は感染症も考えられます。発熱が続く場合は医療機関に相談してください。

Q5：接種後に胸が痛くなった場合はどうすればよいですか？

A5：心筋炎や心膜炎の可能性もあるため、速やかに医療機関を受診してください。強い胸痛や呼吸困難、意識障害がある場合は救急対応が必要です。

Q6：2026年のコロナワクチンも3回目接種と同じ副反応ですか？

A6：発熱、頭痛、倦怠感、接種部位の痛みなどは現在のワクチンでも知られています。ただし、使用する製剤や抗原組成が更新されているため、2021～2022年の3回目接種の調査結果をそのまま現在のワクチンに当てはめることはできません。

まとめ：3回目接種の副反応は経過と症状を見極めることが大切

コロナワクチン3回目の副反応は、接種当日から翌日にかけて現れることが多く、発熱は翌日にピークを迎え、3日後にはほぼ消失する傾向が厚生労働省の健康状況調査で確認されています。

ファイザーとモデルナでは発熱頻度に違いがみられましたが、いずれのワクチンでも接種部位の痛みや倦怠感は多く報告されました。

一方、心筋炎・心膜炎などの重大な副反応や、長期間続く症状についても、2026年現在まで安全性の評価と実態調査が続いています。

特に重要なのは、一般的な一時的副反応と、医療機関での診断が必要な症状を区別することです。

判断のポイントは次の3つです。

1. 発熱や倦怠感は数日以内に改善するか、経過を確認する。
2. 胸痛、息切れ、動悸などの症状があれば速やかに受診する。
3. 症状が長引く場合は我慢せず、医療機関で診断と必要な治療を受ける。

2026年のコロナワクチンをめぐる安全性評価は、過去の接種データだけでなく、最新の製剤、継続的な副反応疑い報告、長期症状の実態調査を合わせて判断する段階にあります。

接種後の体調変化を正しく理解し、必要なときに適切な医療につなげることが、自分自身の健康を守るうえで最も大切です。

参照した主な公的資料

- 厚生労働省「新型コロナワクチンの追加接種（3回目接種）後の健康状況調査」
- 厚生労働省「新型コロナワクチンQ&A」
- 厚生労働省「新型コロナワクチン接種後の遷延する症状に係る実態調査」（2026年7月24日）
- 厚生労働省「第114回副反応検討部会資料」（2026年10月23日）
- PMDA「コミナティ筋注シリンジ12歳以上用 添付文書」（2026年8月改訂）
- 厚生労働省「令和8年10月 新型コロナワクチン定期接種のご案内」

公表資料：

2026年の安全性評価・添付文書：

2026年度の定期接種情報：

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